Habib Subagio lahir di Magelang pada 2 Desember 1974. Ia mengawali pendidikan selama 12 tahun di Magelang, kemudian berlanjut menempuh pendidikan strata satu di Universitas Gadjah Mada dengan Jurusan Kartografi dan Penginderaan jauh.
Habib mengawali karir di Badan Informasi Geospasial (BIG) pada tahun 2003. Pria yang telah melanjutkan pendidikan magisternya di Universitas Gadjah Mada dengan Jurusan Kartografi dan Penginderaan Jauh ini, kemudian mengikuti diklat Fungsional Peneliti Tingkat pertama yang di selenggarakan LIPI pada tahun 2007.
Ketika berkarir di BIG, pada tahun 2012-2015, Ia dipercaya sebagai Kepala Bidang Pemetaan Dinamika Sumberdaya. Setelahnya, Habib yang telah mendapatkan penghargaan Satya Lencana Karya Satya (Penghargaan pengabdian masa kerja 10 tahun sebagai PNS) ini kembali dipercaya menjadi Kepala Bidang Pemetaan Tata Ruang pada tahun selama 2 tahun.
Adapun pada tahun 2016 Habib pernah mendapatkan penugasan lain, yaitu sebagai Tenaga Ahli untuk Komisi Pemberantasan Korupsi (KPK). Kemudian Ia kembali menjadi Kepala Bidang Pemetaan Dinamika Sumberdaya selama 2 tahun. Habib yang juga aktif sebagai Ketua Rukun Tetangga di Beji, Depok ini kemudian didapuk sebagai Inspektur BIG pada tahun 2019 hingga saat ini.
Selama bekerja, Habib pernah menjadi pengisi seminar di beberapa kampus ternama di Indonesia, seperti : Seminar Nasional Geografi dan Pembangunan Berkelanjutan di FMIPA UI dan The 3rd International Symposium for Sustainable Lanscape Deveploment di IPB pada tahun 2017, SEA Studies Symposium 2018 di UI, PIT MAPIN XXV- International Conference of Indonesia Society for Remote Sensing 4rd ICOIRS 2018 yang di selenggarakan MAPIN dan Universitas Hasanuddin. Lalu yang baru saja digelar pada tahun 2019 di IPB yaitu SUWIS “Sustainable Urban Water International Seminar”.
